Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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