Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAPQ14761 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms