Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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