Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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COL4A6Q14031 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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COL4A6Q14031 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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COL4A6Q14031 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
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COL4A6Q14031 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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COL4A6Q14031 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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COL4A6Q14031 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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COL4A6Q14031 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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