Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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