Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms