Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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