Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms