Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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