Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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FOXD4Q12950 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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FOXD4Q12950 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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FOXD4Q12950 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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