Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms