Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMAN2Q12907 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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