Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms