Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF5Q12774 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF5Q12774 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
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