Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
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NUP160Q12769 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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NUP160Q12769 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
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NUP160Q12769 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
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NUP160Q12769 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
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NUP160Q12769 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP160Q12769 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
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