Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms