Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms