Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL16A1Q07092 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms