Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms