Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms