Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7AQ04656 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP7AQ04656 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP7AQ04656 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP7AQ04656 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP7AQ04656 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP7AQ04656 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms