Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms