Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms