Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms