Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms