Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms