Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms