Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms