Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms