Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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