Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX3P78415 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX3P78415 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX3P78415 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX3P78415 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms