Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPD2P62316 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms