Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VBP1P61758 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VBP1P61758 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VBP1P61758 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms