Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF3P61204 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF3P61204 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF3P61204 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF3P61204 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF3P61204 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms