Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms