Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF3P57682 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms