Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK4P57078 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms