Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP6P55212 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP6P55212 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms