Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AFDNP55196 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AFDNP55196 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AFDNP55196 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms