Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms