Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAMP50895 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAMP50895 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAMP50895 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BCAMP50895 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BCAMP50895 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
BCAMP50895 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms