Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERFP50548 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERFP50548 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERFP50548 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERFP50548 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERFP50548 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms