Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLK1P49759 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.9 ms