Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTBP49356 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTBP49356 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTBP49356 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTBP49356 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTBP49356 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTBP49356 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTBP49356 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTBP49356 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNTBP49356 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNTBP49356 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms