Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NESP48681 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NESP48681 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NESP48681 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NESP48681 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NESP48681 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NESP48681 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NESP48681 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NESP48681 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NESP48681 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NESP48681 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NESP48681 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NESP48681 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NESP48681 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NESP48681 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NESP48681 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NESP48681 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NESP48681 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NESP48681 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NESP48681 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NESP48681 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NESP48681 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NESP48681 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NESP48681 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NESP48681 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NESP48681 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NESP48681 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NESP48681 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NESP48681 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NESP48681 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NESP48681 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NESP48681 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NESP48681 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms