Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCLCP48506 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCLCP48506 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLCP48506 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCLCP48506 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCLCP48506 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCLCP48506 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLCP48506 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GCLCP48506 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GCLCP48506 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLCP48506 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCLCP48506 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCLCP48506 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCLCP48506 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCLCP48506 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLCP48506 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLCP48506 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLCP48506 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLCP48506 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLCP48506 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLCP48506 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLCP48506 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLCP48506 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLCP48506 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLCP48506 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms