Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF9P41273 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms