Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5CP41229 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms