Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms