Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms